La qualità dell'acqua influisce in modo significativo sul successo e sull'affidabilità degli esperimenti di PCR. L'acqua contaminata può introdurre impurità nei campioni di DNA, influire sulla fedeltà delle DNA polimerasi e compromettere l'accuratezza dell'amplificazione del DNA. L'acqua ad alta purezza è necessaria per mantenere l'integrità dei modelli di DNA e garantire risultati PCR affidabili.