La qualità dell'acqua utilizzata nell'elettroforesi è fondamentale per ottenere risultati accurati e riproducibili. L'acqua è un componente chiave nella preparazione di gel, tamponi e soluzioni funzionanti. L'acqua impura può introdurre contaminanti che influiscono sulla mobilità delle molecole durante l'elettroforesi, provocando bande distorte e dati inaffidabili.