Genetische Chemie

DNA-Sequenzierung

Die DNA-Sequenzierung ist eine grundlegende Technik in der Genetik, die die Bestimmung der Nukleotidsequenz von DNA-Molekülen ermöglicht. Bei DNA-Sequenzierungsexperimenten ist die Wasserqualität für verschiedene Schritte von entscheidender Bedeutung, einschließlich der Vorbereitung der DNA-Matrize, der PCR und der Sequenzierungsreaktion selbst. Hochreines Wasser ist unerlässlich, um Interferenzen mit DNA-Proben zu verhindern und die Genauigkeit der Sequenzierungsergebnisse sicherzustellen.

Welchen Einfluss hat Wasser auf die DNA-Sequenzierung?

Die Wasserqualität beeinflusst direkt den Erfolg und die Genauigkeit von DNA-Sequenzierungsexperimenten. Verunreinigtes Wasser kann Verunreinigungen in DNA-Proben einbringen, enzymatische Reaktionen bei der PCR beeinflussen und die Integrität von Sequenzierungsreaktionen beeinträchtigen. Hochreines Wasser ist erforderlich, um die Qualität der DNA-Templates aufrechtzuerhalten und zuverlässige DNA-Sequenzierungsergebnisse zu gewährleisten.

Welche Arten von Verunreinigungen im Wasser können die DNA-Sequenzierung beeinflussen?

Zu den Wasserverunreinigungen, die DNA-Sequenzierungsexperimente beeinflussen können, gehören:

Bakterien und Mikroorganismen

Auswirkung:

Bakterielle Kontamination kann die Genauigkeit der DNA-Sequenzierung beeinträchtigen.

Auswirkung:

Unbeabsichtigte Mikroorganismen können zu Variationen in den DNA-Proben führen, was zu Inkonsistenzen bei den Versuchsbedingungen führt und die Zuverlässigkeit der DNA-Sequenzierung beeinträchtigt. Dies kann die Genauigkeit der Nukleotididentifikation beeinträchtigen.

Endotoxine

Auswirkung:

Endotoxine können die Qualität von DNA-Sequenzen beeinträchtigen.

Auswirkung:

In DNA-Sequenzierungsexperimenten können Endotoxine zu Veränderungen der DNA-Struktur führen, was die Genauigkeit des Nukleotidbasenaufrufs beeinträchtigt. Dies kann die Zuverlässigkeit der Ergebnisse der DNA-Sequenzierung beeinträchtigen.

Organische Verbindungen

Auswirkung:

Kleine organische Verbindungen in Wasser können bei DNA-Sequenzierungstests unerwünschte Signale auslösen.

Auswirkung:

Organische Verunreinigungen wie Huminsäuren und Pestizide können die Reinheit von DNA-Proben beeinträchtigen. Die Entfernung dieser organischen Verbindungen aus den DNA-Sequenzierungspuffern ist entscheidend, um genaue und zuverlässige Sequenzierungsergebnisse zu gewährleisten.

Ionische Verunreinigungen

Auswirkung:

Ionische Kontaminanten können DNA-Sequenzierungsanalysen stören.

Auswirkung:

Erhöhte Ionenwerte können die Stabilität der DNA-Strukturen während der Sequenzierung beeinträchtigen und zu Variationen der Sequenzierungsergebnisse führen. Die Aufrechterhaltung eines niedrigen Gehalts an ionischen Kontaminanten ist für die Reproduzierbarkeit und Genauigkeit der DNA-Sequenzierung unerlässlich.

Anforderungen an die Wassermessung für die DNA-Sequenzierung

Bei der DNA-Sequenzierung hängen die Genauigkeit und Zuverlässigkeit der Ergebnisse von der Qualität des für die Analyse verwendeten Wassers ab. Die Auswahl des Wassers ist auf die Empfindlichkeit der verwendeten DNA-Sequenzierungsmethoden zugeschnitten. Für Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken, die Präzision erfordern, die Verwendung von apyrogenen, ultrareinen TypWasser Typ 11 Wasser wird dringend empfohlen.

Wasserqualitätsstandards gemäß Industrierichtlinien:

Resistivity (MΩ.cm)*

>18

TOC (ppb)

<10

Filter (μm)

<0.2

Bacteria (CFU/ml)

Endotoxins (EU/ml)

<0.002

Nucleases

Not detected

Widerstand (mΩ.cm) *

Gesamtwert (ppb)

Filter (μm)

Bakterien (KBE/ml)

Endotoxine (EU/ml)

Nukleasen

>18

<10

<0,2

<0,002

Nicht erkannt

Die Einhaltung dieser Wasserqualitätsstandards ist entscheidend für den Erfolg und die Genauigkeit von DNA-Sequenzierungsexperimenten. Wasser vom Typ I wird für kritische DNA-Sequenzierungsanwendungen empfohlen, während Wasser vom Typ II für Routineexperimente geeignet sein kann.

ANMERKUNGEN:

Anwendungen, die eine Endotoxinfiltration erfordern, sollten einen CLF-5000-02E-Endfilter zur Endotoxinentfernung erwerben.

CLS-3400

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CLïR 3400 High Purity Lab Water System with 0.05 Micron Ultrafiltration and UV

25.25

⅜" O.D. Tubing

120V/60Hz

> 18 MΩ/cm

< 10 CFU / ml

< 1ppb

< 5 ppb

Countertop, Wall Mount

DNA Sequencing, Forensics, Genetics, Molecular Biology, Polymerase Chain Reaction (PCR)

Genetic Chemistry

CLS-5400-R-1-TOC

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CLiR 5400 Ultrapure Lab Water System with TOC Monitoring, UV Disinfection & Ultrafiltration (Remote 120v)

14.4

21.6

14.7

⅜" O.D. Tubing

120V/60Hz

> 18 MΩ/cm

< 1 CFU/ml

< 1ppb

Wall Mount, Remote Dispense

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CLiR 5400 Ultrapure Lab Water System with TOC Monitoring, UV Disinfection & Ultrafiltration (Remote 220v)

14.4

21.6

14.7

⅜" O.D. Tubing

220V/50Hz

> 18 MΩ/cm

< 1 CFU/ml

< 1ppb

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< 1 CFU/ml

< 1ppb

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System

Etikett

Systemtiefe (Zoll)

Systemhöhe (Zoll)

Systembreite (Zoll)

Trockengewicht (lbs)

Einlassanschluss

Systemspannung

TOC-Überwachung

0,05μ-Ultrafiltration

Ultraviolette Oxidation

Reinheit des Abwassers

Abfließende Mikroorganismen

Abfließendes Natrium

Abfließendes Chlorid

Abwasser TOC

Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

Volumetrische Voreinstellungen

Montage

Anwendungen im Labor

Kategorie

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Systembreite (Zoll)

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Ultraviolette Oxidation

Reinheit des Abwassers

Abfließende Mikroorganismen

Abfließendes Natrium

Abfließendes Chlorid

Abwasser TOC

Maximaler SystemwertLeistung (lpm)

Volumetrische Voreinstellungen

Montage

Anwendungen im Labor

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Systemhöhe (Zoll)

Systembreite (Zoll)

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Einlassanschluss

Systemspannung

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Volumetrische Voreinstellungen

Montage

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Systemtiefe (Zoll)

Systemhöhe (Zoll)

Systembreite (Zoll)

Trockengewicht (lbs)

Einlassanschluss

Systemspannung

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0,05μ-Ultrafiltration

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Maximaler SystemwertLeistung (lpm)

Volumetrische Voreinstellungen

Montage

Anwendungen im Labor

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Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

Maximaler Systemwert
Leistung (lpm)

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Leistung (lpm)